Endoskope werden nach ihrer Art der Bildübertragung in Glasfaser- und Videoendoskope unterschieden. Die Bildübertragung erfolgt in Fiberglas-Endoskopen über lichtleitende Fasern zum Okular. Beim Video-Endoskop nimmt der Videochip das Bild auf und es wird über elektrische Leitungen zum Prozessor geleitet. Der Prozessor überträgt das Bild dann auf den Monitor.
Flexible Endoskope werden eingesetzt zur Untersuchung von Organen und Betrachten derer Schleimhaut und zu Interventionen. Zu dem Zweck gibt es Endoskope mit unterschiedlichen Außendurchmessern, Längen, Biopsiekanaldurchmessern und Funktionen.
Weiter werden Endoskope in flexible und starre Endoskope eingeteilt.
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